แผ่นกรองพัดลมแบบแกนเป็นแผ่นกรองที่กรองเศษวัสดุและสารปนเปื้อนออกจากอากาศขณะที่ถูกดึงเข้าไปในพัดลม แผ่นกรองช่วยป้องกันความร้อนสูงเกินไปและป้องกันไม่ให้อุปกรณ์เสียหายโดยป้องกันไม่ให้ฝุ่นและเศษวัสดุเกาะบนใบพัดลมและเข้าไปในตัวเครื่อง แผ่นกรองแบบแบนบางเหล่านี้เรียกอีกอย่างว่าแผ่นกรองพัดลมแบบมัฟฟิน โดยจะพอดีกับด้านหลังตัวป้องกันพัดลมแบบแกนที่เข้ากันได้และใช้เพื่อเปลี่ยนแผ่นกรองที่อุดตันหรือเสียหาย แผ่นกรองเหล่านี้มักติดตั้งบนพัดลมที่ทำงานในบริเวณที่มีฝุ่นละออง